桔梗山战役木叶大胜，不仅将砂忍彻底赶出火之国，还在山上捉了许多俘虏，包括小部分砂忍以及大量风之国平民。
而砂忍退出火之国，也代表着两国的战争将以木叶的胜利做为结局，而带来这一切的是大蛇丸！
于是顺理成章的，大蛇丸的名望瞬间达到顶峰，当他带着俘虏回村，木叶无数平民夹道欢呼，万人空巷。
猿飞日斩站在火影楼的天台上，眺望着这一幕，眼中却有几分凝重以及迟疑。
和砂隐村的战争暂告一段落，所以他派去协助大蛇丸的暗部也已经提前一步回来。
从暗部嘴中，猿飞日斩察觉到了一些身处地底的黑暗身影。
根部！
猿飞日斩的思绪逐渐飘到了过去。
四十多年前，木叶建立没多久，号称忍界之神的初代火影千手柱间去世了，他死后，木叶失去木遁，在忍界地位一落千丈，没多久就爆发一战，二代火影也挂了，之后猿飞日斩继承三代火影。
为了尽快提升村子的实力，猿飞日斩同意团藏的要求，允许他以‘暗部培训部’的名义成立根部，之后，为了预防九尾暴走的威胁，猿飞日斩又和团藏一起利用初代的细胞做人体实验，企图培育出新的木遁忍者！
没错，利用千手柱间细胞做人体实验的除了团藏，猿飞日斩也做过！
但遗憾的是，他们的人体实验全部失败，作为实验体的志愿者们也无一例外全部死亡。
猿飞日斩无奈，只得叫停实验，然后将实验的数据、记录等作为黑历史封存起来。
之后爆发第二次忍界大战，猿飞日斩的三个弟子，大蛇丸、自来也、纲手闯出了三忍的名号。
同时团藏的根部也活跃起来，到处搜集尸体和俘虏，猿飞日斩一看，暗想小老弟你是不是背着我偷偷的搞人体实验？
于是猿飞日斩将大蛇丸派过去给团藏当亲随，一是为了表示对团藏的信任与器重，二是监视团藏以及他的根部有没有在继续做人体实验！
通过大蛇丸，猿飞日斩确认了团藏没有继续研究，或许是抱着愧疚的心思，之后猿飞日斩对团藏更加信任，放权的尺度也越来越大，没过多久，猿飞日斩就随便找了个理由让大蛇丸离开了根部。
猿飞日斩以为事情就这样结束了，直到现在。
从暗部的汇报中，他发现跟随大蛇丸前往砂忍战场的除了暗部忍者，还有团藏的根部忍者。
而且到了战场后，大蛇丸竟然将暗部忍者统统打散调入各个部队，而根部忍者，却被他全部留下充当护卫队！
也就是说，相比起猿飞日斩这个老师的暗部，大蛇丸更加信任团藏的根部！
在确认了大蛇丸和团藏的亲密关系后，受伤的猿飞日斩不得不怀疑大蛇丸在根部监视团藏时传回的情报的可信度。
团藏，真的已经停止了人体实验？
接着，猿飞日斩立即查看了大蛇丸抵达前线后，木叶大营后勤记录的尸体数量，发现村子忍者的尸体没少，但砂忍的尸体却是一具都没有！
要知道在大蛇丸之前，他们可是缴获了不少砂忍尸体，甚至是活着的砂忍俘虏，但大蛇丸到前线后，生不见人，死不见尸！
摆明了是被大蛇丸拿走了。
这些东西，细思极恐，猿飞日斩都不敢往下想象。
当然，这一切也可能是自己多心。
猿飞日斩脸色沉重，但以防万一，还是要调查一番，但遗憾的是，就在这个时候土之国、雷之国先后宣战，瞬间将猿飞日斩的注意全部转移过去。
早在木叶和砂忍、雾忍战争爆发时，猿飞日斩就已经派遣了大量忍者驻守在边境线，但到战争真正爆发，该暴露的问题还是暴露了。
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